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Emilio Núñez Borque se graduó en Biología Sanitaria por la Universidad de Alcalá de Henares (UAH) en 2017 y colaboró, ese mismo año, durante 5 meses en el laboratorio de la Dra. Martín Requero en el Centro de Investigaciones Biológicas (CIB), donde realizó tanto sus prácticas como su trabajo de fin de grado titulado "Evaluación a nivel pre-clínico de agonistas de cannabinoides en linfocitos inmortalizados de pacientes de Alzhéimer”. Tras esto, en 2017-2018, cursó el Máster en Investigación en Inmunología de la Universidad Complutense de Madrid (UCM) y realizó las prácticas y el trabajo de fin de máster en el laboratorio de Inmunoalergia y proteómica del Instituto de Investigación Sanitaria – Fundación Jiménez Díaz (IIS-FJD) bajo la supervisión de la Dra. Esteban. Precisamente, en este grupo ha desarrollado su tesis doctoral titulada “Identificación de biomarcadores y estudio de las bases moleculares en anafilaxia: proteínas circulantes, vesículas extracelulares y microARNs”, defendida en 2023. Sin embargo, durante este tiempo, también ha colaborado en la realización de varios casos clínicos de alergia, en el estudio de diferentes perfiles alergénicos, en la realización de varios modelos animales (sensibilización a Pru p 3 y esporas, inmunoterapia, metabolómica etc...), así como en otros proyectos en el área de la alergología. Además, en 2022 realizó una estancia predoctoral de 3 meses en el laboratorio de Oncohematología Pediátrica de la Dra. Di Giannatale en el Hospital Pediátrico “Bambino Gesù” de Roma, Italia, con el fin de analizar los niveles del miR-375 en las vesículas extracelulares de pacientes con anafilaxia y evaluar del papel de estas vesículas en los mecanismos moleculares subyacentes a la reacción anafiláctica. Actualmente, desde enero de 2024, es investigador postdoctoral en el departamento de inmunología del Hospital Universitario de la Princesa con un contrato Sara Borrell.